由我会和中国植物学会共同组成的全国中学生生物学竞赛委员会自1992年成立至今已陆续举办了10届全国中学生生物学联赛、17届全国中学生生物学竞赛、17次冬令营选拔赛；并先后培训选手参加了16次国际生物学奥林匹克竞赛。
　　2008年12月8日发布了“2009年全国中学生生物学竞赛（初赛）通知”，要求各省竞赛委员会负责组织本省参赛学生报名，并按要求设置考点、编制考场及考号。截止2009年3月31日，全国共有30个省、自治区、直辖市的118,739名中学生报名。其中云南省是第一次参赛。
　　通知要求各省竞赛委员会在接到联赛通知后及时报告本省竞赛管理委员会，若本省目前还未成立竞赛管理委员会则上报告省科协青少年科技中心或科学普及部，共同制定试卷保密措施。我会为了加强试卷印刷过程中的保密工作，与印刷厂签订了保密协议，并派人监督印刷、包装等每一环节。今年联赛理论试题的答卷全部使用机读卡。试卷及机读卡严格按标准考场30份一个小包装袋，8个试卷袋一个大包装的形式包装并贴封条盖章，于考试前三周以机要通讯方式（绝密件）寄往各省、自治区、直辖市竞赛管理委员会或竞赛委员会负责同志。各省、自治区、直辖市竞赛委员制定保密措施和设立保密员，确保试卷的安全。各省、自治区及直辖市各考点，由总监考人在开考前10分钟将试卷发到每个考场或考场监考老师，由考场监考老师在开考前5分钟当考生面拆封试卷；考试结束后，当场将机读卡密封装在试卷袋里并写出监考记录，并于当天将机读卡袋送或寄回各省竞赛委员会；由各省竞赛委员会集中组织阅卷工作。通过这一系列措施，保证了竞赛工作的保密性、严肃性和公正性。
　　在各省竞赛委员会的大力支持下，联赛理论考试于5月10日上午9：00－11：00顺利进行。各省、自治区、直辖市理论试卷批改结束后，组织个人成绩居本省、自治区、直辖市全部考生成绩前2％者（上限一倍于一等奖人数）进行实验复赛。由全国竞赛委员会指定实验考试范围，各省、自治区、直辖市自行在指定范围内命实验试题。理论考试得分与实验考试得分按80％：20％比例进行分配，两项成绩按比例计算后加出总分，重新排定名次，总分居本省、自治区、直辖市考生前1％者（基础名额20人，并加奖励名额）为一等奖，二、三等奖的学生人数分别占当年参加本省、自治区、直辖市生物学联赛考生总数的4％（上限100人）、5％（上限200人）。截止到7月30日各省、自治区、直辖市联赛工作陆续结束。
　　9～11月各省将参加实验复赛学生的理论试卷、实验试卷陆续寄到全国竞赛委员会。全国竞赛委员会组织有关同志对所有试卷进行了严格复核，对试卷批改存在问题的及时反馈给省竞赛委员会，并要求省竞赛委员会再进行复核，以全国竞赛委员会和省竞赛委员会双方复核认可的成绩为准，共评出2009年全国中学生生物学联赛一等奖670名，二等奖2,789名，三等奖5,450名，对一等奖获得者进行了统一编号，并颁发了一、二、三等奖证书及一等奖学生指导教师证书。